Styrelsen nedsætter en række udvalg, der har hvert deres arbejdsområder. Alle NETOPs udvalg refererer til styrelsen. Desuden har udvalgene hver en eller flere medarbejdere tilknyttet som sekretærer.
Forretningsudvalg
Forretningsudvalgets primære opgave er at forberede styrelsesmøderne og sikre, at styrelsen får det rette grundlag til at træffe beslutninger. Dertil kommer at udvalget kan træffe hurtige beslutninger samt følge den daglige drift i NETOP og sparre de ansatte på nærmere hold, end det er muligt for hele styrelsen.
Puljeudvalget
En væsentlig del af NETOPs tilbud til medlemsforeningerne er, at de kan søge støtte til forskellige projekter med mere. Puljeudvalget har dels til opgave at udvikle, hvilke former for støtte foreningerne kan søge, og dels stå for behandlingen af indsendte ansøgninger.
Kursusudvalget
NETOP lægger stor vægt på, at alle aktive i NETOPs foreninger har mulighed for at udvikle evner og kompetencer i forhold til deres arbejde i NETOP. Det gælder for både undervisere, administrativt personale og politisk valgte personer. For at sikre, at NETOPs kurser løbende bliver udviklet og svarer til behovene, er der nedsat et udvalg, der arbejder med NETOPs kursusvirksomhed internt i NETOP.
Redaktionsudvalget
NETOPnyt er NETOPs medlemsblad. Den daglige redaktion udøves af landssekretariatets ansatte ud fra overordnede linier, der er udstukket af redaktionsudvalget. Dette udvalg mødes fire til seks gange om året og evaluerer de udgivne numre samt udarbejder ideer til nye temaer og artikler.
Internationalt udvalg
Det er en af NETOPs grundlæggende værdier at skue ud over Danmarks grænser - både for at søge inspiration og for at sprede folkeoplysningens budskab. NETOPs internationale udvalg har til opgave at virke som inspirator og udvikler af de internationale dimensioner i NETOPs aktiviteter.